Wicri:SpintronicV3

De Wicri Terre
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Cette page introduit les aspects techniques de la version SpintronicV3 du Serveur d'exploration « Spintronique (multi-base) ».

Voir aussi :

Mise en œuvre

Sur la machine de développement

Initialisations

Génération des pages wikis
source IstexGetCorpusSize -q "spintronic*"
 IstexGenerAreaPages \
       -a SpintronicV3   \
       -m   \
       -g Spintronic   \
       -p Wicri/Terre   \
       -w wicri-terre.fr  \
       -W Wicri/Terre   \
       -s Pascal  \
       -s HalV3   \
       -s PubMed   \
       -s Pmc   \
       -s Ncbi   \
       -z France   \
       -z Allemagne   \
       -z USA   \
       -t "Spintronique (multi-base)"
Définition $EXPLOR_AREA
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Terre/corpus/Spintronic.storage/SpintronicV3
export EXPLOR_AREA
export LC_ALL='C'
Création des répertoires
mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Terre/corpus/Spintronic.storage
mkdir $EXPLOR_AREA
mkdir $EXPLOR_AREA/Import

Récupération des corpus

En cas de reprise au niveau du téléchargement
rm -rf $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.h*
IstexGetCorpus  -q "spintronic*" -s 5000 -A \
     | IstexToSxml     \
     | HfdBuild -bh    $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository
En cas de reprise
rm -rf $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata.h*
Construction corpus biblio
HfdCat $EXPLOR_AREA/Import/IstexRepository.hfd   \
  | IstexCleanFullText                           \
  | SgmlFast -c1                                 \
  | IstexToTei                                   \
  | TeiPutRefToIdno -t wicri:Area/Istex/Corpus \
  | HfdBuild -h $EXPLOR_AREA/Import/IstexMetadata

Téléchargement des autres corpus

PubMed

Site : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

Requête :

 spintronics*

Ranger le résultat dans $EXPLOR_AREA/Import/pubmed_result.xml

PubMed Central

Site : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc

Requête :

 spintronics*

Ranger le résultat dans $EXPLOR_AREA/Import/pmc_result.xml

PascalFrancis

Site :http://stan2.demo.inist.fr/fr/

Requête :

 spintronics*

Télécharger avec les onglets : Serveur / SGML / SGML / LF

  • résultat dans $EXPLOR_AREA/Import
 mv $EXPLOR_AREA/Import/corpus.txt $EXPLOR_AREA/Import/inistServer.txt 

Télécharger avec les onglets : SGML / SGML / SGML / LF

  • résultat dans $EXPLOR_AREA/Import
 mv $EXPLOR_AREA/Import/corpus.txt $EXPLOR_AREA/Import/inistStandard.txt

Génération de la plateforme

Importation des paramètres de génération
WicriGetPage -l wicri-terre.fr -p "Wicri:SpintronicV3/Paramètres, data"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaParam.data.wiki

Si reprise

sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaReset.sh
ExplorAreaDataCreate -d $EXPLOR_AREA
make -f $EXPLOR_AREA/bin/area.mk
Importation des paramètres de navigation
WicriGetPage -l wicri-terre.fr -p "Wicri:SpintronicV3/Paramètres, fr"\
      > $EXPLOR_AREA/Import/WicriAreaSiteParam.fr.wiki
Génération de l'interface 
sh $EXPLOR_AREA/bin/AreaCreateSite.fr.sh

Génération des FTP

cd $EXPLOR_AREA
rm Site.tar.gz 
tar -cvf Site.tar Site 
gzip Site.tar 
rm Data.tar.gz 
tar -cvf Data.tar Data 
gzip Data.tar 

rm ImportMetadata.tar.gz
tar -cvf ImportMetadata.tar Import/istexMetadata.hcs Import/istexMetadata.hfd
gzip ImportMetadata.tar

Sur la machine cible

Aller sur le répertoire corpus correspondant au wiki cible

. ... Dilib/init.sh  
newgrp ticri
EXPLOR_AREA=$WICRI_ROOT/Wicri/Terre/corpus/Spintronic.storage/SpintronicV3.20151216

Si nouveau code générique :

mkdir $WICRI_ROOT/Wicri/Terre/corpus/Spintronic.storage

Création du répertoire plateforme

mkdir $EXPLOR_AREA
Transfert par FileZilla

Transférer les fichiers Site.tar.gz, Data.tar.gz de SpintronicV3 (émetteur) vers SpintronicV3 (cible).

Installation
cd $EXPLOR_AREA
gunzip Site.tar.gz 
tar -xvf Site.tar 
gzip Site.tar 

gunzip Data.tar.gz 
tar -xvf Data.tar 
gzip Data.tar
gunzip ImportMetadata.tar.gz 
tar -xvf ImportMetadata.tar 
gzip ImportMetadata.tar 

cd Data/Istex/Corpus 
rm biblio.hcs 
rm biblio.hfd 
ln -s ../../../Import/istexMetadata.hcs biblio.hcs 
ln -s ../../../Import/istexMetadata.hfd biblio.hfd