Dilib, module Nlm, flux Medline

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Bibliothèque Dilib (ressources numériques)
Module Nlm

Cette page introduit les outils utilisés relatifs à des flux de données provenant la base Medline de la NLM (interface PubMed), et plus particulièrement pour un espace d'exploration (Dilib, module Explor).

 

Import de données

Téléchargement

Pour décharger un corpus Medline, il faut utiliser l'interface entrez du NCBI :

Lorsque le corpus est prêt, il faut utiliser l'onglet « Send To » (en haut à droite) et choisir le mode File avec le format XML.

Conversion

Pour convertir en Stream Xml

   | NlmPubMed2SxmlStep1   \
   | NlmPubMed2SxmlStep2   \
   | SxmlUnIndent